对于涉密论文归档、保管环节的保密管理，正确的做法是：答辩结束后，涉密学位论文（包括正式文本、草本和电子文档）和相关申请、评审材料应当移交给所在院系、部门指定的人员，并填写涉密学位论文移交清单。各高校、科研院所对涉密学位论文进行统一管理。导师应当及时监督学生销毁多
多余的学位论文，或交学校保密机构处理，确须留存的应由导师按照学校涉密载体管理规定集中保管。对于需提交到图书馆的涉密学位论文，需要双方有关人员进行充分沟通，明确提交的论文中是否包含涉密学位论文。图书馆对接收的涉密学位论文应当逐一明确密级和保密期限，对收藏情况进行登记整理，建议按照解密时间进行排序。对于提交到有关数据库网站的学位论文，则要严格核实比对，杜绝刊登涉密学位论文的案件发生。
准确解密很重要
一些高校、科研院所规定，涉密学位论文保密期限届满，即对社会公开。但在实践中，由于定密不准，特别是保密期限确定有误，很容易造成保密期限届满，但论文实质上仍然属于国家秘密的问题出现。
为解决这一问题，高校、科研院所应当加强对涉密学位论文的动态管理。在保密期限内的涉密学位论文，要按照《国家秘密定密管理暂行规定》的要求，每年进行审核，符合解密条件的，及时解密。慎重起见，高校、科研院所在对涉密学位论文进行解密时，应征询该涉密学位论文所依托的涉密项目委托方和课题组的意见，避免因为擅自解密造成国家秘密的泄露。需要延长保密期限的，应及时采取措施，并通知有关知悉单位（包括论文收藏机构）和人员。如，《清华大学研究生学位论文保密管理规定》要求：“涉密学位论文的密级调整或保密期限变更，每年3月集中调整一次。由档案馆将上一年保密期限届满的论文清单转交保密办公室，由保密办公室转交各院（系、所）保密领导小组，各院（系、所）对需要变更密级或保密期限的论文提交‘研究生学位论文密级调整/保密期限变更申请表’，报学校保密委员会批准。密级与保密期限未变更而届满的涉密学位论文将自行解密，解密后按公开论文处理。”
图书馆等涉密学位论文的收藏机构，需要解密涉密学位论文时，首先应当考虑提交单位的解密意见，在得到对方的解密许可后，方可进入解密程序。其次，要严格按照解密时间进行解密。论文中明确标明解密时间的，可以在解密期限届满时进行解密处理，而没有标明解密时间的应当先与提交单位联系，确认解密时间，或者参照国家制定的保密期限相关规定，必要时征询论文提交单位的意见。
